«Mononoke The Movie: The Phantom in the Rain» ender med at medisinselgeren konfronterer Ayakashi, som er hjemsøkende salene til fødselsseremonien. Den legendariske overvinneren av Mononoke står overfor den vanskelige oppgaven med å finne åndens plassering samtidig som han prøver å finne dens opprinnelse. Selv om årsakene fortsatt er uklare, får seerne et innblikk i det undertrykkende miljøet i Ooku og politikken som forgifter dets indre, hovedsakelig gjennom øynene til de sentrale karakterene, Asa og Kame. Noe føles drastisk av begivenheten, inkludert de kjødelige hendelsene i keiser Tenshis kammer. I de siste øyeblikkene dukker det opp et klarere bilde av seremonien og mørket som brer seg inni den. Imidlertid fraråder det fortsatt ikke tvetydigheten i fortellingen. SPOILERE FORAN.
Dager før feiringen av keiser Tenshis nyfødte barns fødselsseremoni, går Asa og Kame, to unge jenter, inn i tjenesten til majestetens harem. Førstnevnte søker å fremme sin karriere som skribent ved å bli sjefsskriver i Ooku, mens sistnevnte ønsker å bli en medhustru for keiseren. Selv om de har kontrasterende motivasjoner, blir de to jentene raske venner etter å ha blitt innviet i seremonien av de to madammene som er ansvarlige for saksbehandlingen, Awashima og Mugitani. Imidlertid innser de umiddelbart at noe er galt med stedet etter at de er tvunget til å drikke vann fra brønnen som smaker harskt. De får også beskjed om å kaste sine mest kjære tilhørigheter fra bagasjen i brønnen før de begynner å tjene keiseren.
I de ytre lokalene til seremonien gjennomfører medisinselgeren en undersøkelse ved å bruke sine åndelige verktøy for å fastslå tilstedeværelsen av en Ayakashi. Siden ingen har lov til å gå inn i Ooku, må han være diskret med detektivarbeidet sitt, ofte under oppsyn av palassvakten Sakashita. Etter hvert får han vite at en mektig kraft brygger i det indre av seremonien, noe som forklarer noe av det rare som Kame og Asa opplevde. Mens de to jentene kommer i kontakt med seremoniens sjefshoncho, Madam Utayama, synes de også at regimet hennes er tøft og generelt et hardt miljø. Saker blir enda mer kompliserte når Asa støter på en fremmed kvinne ved navn Kitagawa på det nye rommet sitt, som virker bekymret for at den unge jenta «tørker opp».
Etter å ha blitt med i seremonien som nye rekrutter, blir de to jentene tildelt lave stillinger som hushjelper og får jobbe dag og natt for gjestene, som snart kommer når Ooky er i gang. Asa tar fatt på jobben sin flittig, mens Kame sliter på grunn av sin naivitet og ungdommelige overflod. Førstnevntes kompetanse tiltrekker seg snart hån og misunnelse fra hennes overordnede, Awashima og Mugitani, spesielt etter å ha blitt forfremmet til en høyere rang en dag etter at hun ble med. Kame blir også målet for fruene sine på grunn av hennes manglende evne til å utføre jobbene sine ordentlig og er en naturlig skjønnhet. I mellomtiden avhører to tilreisende samuraier fra regjeringen Madam Utayama om hvorfor arrangementet ble forsinket med måneder – et spørsmål som ikke får tilstrekkelig svar.
Mens medisinselgeren fortsetter etterforskningen, snubler han sakte over en rekke urovekkende funn, som på grunn av hans enorme erfaring ikke overrasker ham det minste. Imidlertid går disse oppdagelsene hånd i hånd med Kama og Asas personlige reise mens de jobbet som tjenestejenter under fødselsseremonien. De to distinkte plottrådene kommer til slutt sammen når medisinselgeren endelig bekrefter tilstedeværelsen av Ayakashi i bygningen, som han kaller Karakasa. Angrepene er ofte raske og skjer når Kame er i trøbbel med fruene sine. Ikke overraskende er de første drapsofrene til Karakasa Madam Mugitani og Awashima, som prøver å mobbe Kame ved å bruke ekstreme taktikker. Kroppene deres er fullstendig tørket opp av ånden og teleportert ut av syne.
Senere blir åndens modus operandi og dens bakhistorie tydeligere ettersom medisinselgeren klarer å fastslå hvordan den manifesterer seg i virkeligheten. Ettersom de fleste Mononoke blir til på grunn av negative menneskelige følelser, er en spesiell historie knyttet til hver av dem. Når det gjelder Karakasa, er opprettelsen knyttet til Madam Kitagawa, den merkelige kvinnen som besøker Asa noen ganger. Damen blir venn med Asa og gir henne verdifulle råd om å overleve som medlem av seremoniens husholdning, og ber henne holde på noe verdifullt for henne, da det er den eneste måten hun ikke vil tørke ut. Hennes bruk av uttrykket «tørke opp» passer perfekt med måten Karakasa disponerer ofrene på. Imidlertid knytter det seg til Lady Kitagawas personlige opplevelser mens hun tjente som hushjelp ved seremonien.
Som det viser seg, hadde Kitagawa, i likhet med Asa, blitt med på fødselsfeiringen for å gjøre henne kjent som en talentfull skribent. Men etter hvert som tiden gikk, ble hun offer for de invasive kvinnefiendtlige praksisene som var rådende innenfor seremoniens ortodoksi, noe som tæret på identiteten hennes. Også hun hadde en nær venn som Kame i livet, men på grunn av ansvaret som ble lagt på skuldrene hennes, kuttet hun alle båndene sine med jenta og bestemte seg for å fokusere på oppgavene sine. Senere fikk hun vite at jenta ble drept, og kroppen hennes ble kastet i brønnen. Det gjorde at hun ble mer og mer tørket følelsesmessig og førte til at hun hoppet ned i brønnen for å ta livet av seg. Ved hennes bortgang hadde hennes negative følelser og følelser gitt opphav til Mononoke. Derfor drepte ånden alle som utfordret Asa og Kame fordi den kjente et slektskap med de to jentene.
Men når man løser mysteriet, blir det klart at Karakasa faktisk ble levende etter at Kame kastet bestemorens kam i brønnen. Det er et resultat av de eldgamle tradisjonene som undertrykte kvinnene i Ooku, og bandt dem til deres ansvar mens de ikke ga dem noe rom for uttrykk eller frihet. Karakasa er en kaotisk manifestasjon av den opprørske ånden som lurte i Kitagawas sjel. Fordi hun ikke kunne slå tilbake, tok ånden over fra henne og fikk en form og ny leie ved at kamnålen ble kastet i brønnens vann. Det er også mulig at Kitagawas ånd fornemmet en likhet mellom Kame og jenta som hadde vært hennes venn tidligere, noe som sørget for at det ikke skjedde noe forferdelig med henne denne gangen.
Selv om det å finne ut Karakasas tilstedeværelse er det første trinnet i medisinselgerens reise for å komme til bunns i saken, klarer han fortsatt ikke å håndtere det på grunn av mangelen på informasjon. Siden hans eneste metode for å overvinne en slik fiende er å bruke hans legendariske hellige sverd, Kon, må hovedpersonen oppdage tre ting om Ayakashi før han kan trekke sverdet sitt – dets form, sannhet og fornuft. Medisinselgeren lærer den første delen etter å ha oppdaget dens tilstedeværelse før noen andre og bestemt dens sirkulære natur ved å studere fuktighetsmønsteret på gulvet. Den passer også godt sammen med dukken som Kitagawa har gitt Asa, som merkelig nok mangler en paraply. Den sirkulære formen minner om formen til en paraply og den virkelige formen til demonen som hjemsøker Ooku.
Den andre delen av de tre kravene hans er oppfylt etter at medisinselgeren kobler åndens eksistens til Lady Kitagawa, mens den tredje blir tydeliggjort etter at han endelig lærer den tragiske bakhistorien bak Karakasas fødsel. Med alle tre tingene endelig i grepet, trekker han sverdet på slutten av filmen og engasjerer seg i en kamp i full skala med Mononoke. Sluttkampen tar en rekke forvirrende vendinger. Det begynner imidlertid når Saburomaru, en av de to samuraiene som bor i seremonien, tar et dykk ned i den forurensede brønnen og oppdager de døde kroppene til alle tjenestejentene fra fortiden, og det er også grunnen til at vannet smaker harskt. Deretter avslører Karakasa seg selv ved å prøve å drepe Madam Utayama, som ånden anser som kilden bak alle de onde praksisene i Ooku.
Ved å bruke sverdets fulle kraft forvandler medisinselgeren seg og tar kampen mot Ayakashi, holder det tilbake og beskytter folket i dets nærvær. Det varer ikke lenge siden han raskt er i stand til å overvinne den ved å knuse den i en million biter. Selv om det avslutter syklusen av hat og vold som hadde slått rot i fødselsseremonien, var de samfunnsmessige problemene som hadde manifestert Ayakshi fortsatt ganske sterke så lenge Utayama overlevde. De siste øyeblikkene avslører imidlertid at den autoritære fruen har blitt kastet ut. Det er fortsatt uklart om hun ble degradert og sendt bort på grunn av hemmelighetene hun hadde holdt skjult for den undersøkende samuraien, eller om hun døde i den siste krangelen med Karakasa. Uansett betyr det en ny daggry for fødselsseremonien.
Filmens siste øyeblikk konsentrerer seg om Asa og Kames skjebne i kjølvannet av kampen. Etter at Madam Utayama er fjernet, faller byrden med å organisere arrangementene på Asa, som overtar rollen som hovedhoncho. Hun bestemmer seg for å omfavne livet sitt som leder av showet, men med en iver etter å rette opp forgjengerens mangler, spesielt i hvordan hun bruker autoriteten sin uten å misbruke den som andre. Etter å ha levd gjennom tragedien til Lady Kitagawa, virker det usannsynlig at hun vil gå gjennom de samme fallgruvene siden utviklingen hennes er mer forsiktig og mye mer følsom. Avgjørelsen hennes om å bli ved seremonien betyr imidlertid at forholdet hennes til Kame tar slutt. Ungjenta flytter ut av stedet og bærer med seg en ny kamnål mens Asa blir igjen.
Ettersom Asa og Kame hadde vært så nære gjennom hele fortellingen, bringer deres avgang fra hverandres liv et bittersøtt element til slutten, spesielt hvis du leser inn i båndet deres med en mer romantisk aspekt til det. Selv om følelsene kunne vært rent platoniske, er det en følelse av hjertesorg når de to ender opp med å skilles. Det føles imidlertid uunngåelig, med tanke på hvor forskjellige de er som mennesker og det ansvaret de hver og en må påta seg ettersom tiden går. Det er usannsynlig at Asa noen gang vil være like frisinnet som Kame, og på samme måte er det usannsynlig at den andre jenta noen gang blir lenket av forventninger og karrieremål. De er både som de er og hva de er av en grunn, og det kommer ikke til å endre seg.